Az elkészült pálinkát a palackozás előtt még hónapokig, adott esetben évekig tároljuk. A tárolás célja a pálinka pihentetése. A pihentetés azt jelenti, hogy napfénytől elzártan tartjuk rozsdamentes acéltartályokban, és időnként megszellőztetjük. Így „elsimulnak” a párlat aromái:
a középpárlatban található savak, az alkohol, valamint az oxigén elkezdenek dogozni, és egymással reakcióba lépve kellemes aroma anyagokat hoznak létre.

Az üvegekbe palackozott pálinka még további hónapokat pihenhet mielőtt értékesítése megtörténik.